生殖系统感染是不育的重要根源，也是女子手淫的苦果之一。未婚女子阴道防卫功能尚不十分健全，阴道黏膜比较脆弱，在异物的刺激下容易发生充血水肿及黏膜损伤，从而为病菌侵入大开方便之门。如果手淫工具不卫生，那就更易发生感染。如有的女子喜欢用果蔬进行手淫，其上的农药或病菌对阴道黏膜会造成严重损伤，甚至导致农药中毒。有些女子喜欢用圆滑的玻璃制品当做手淫工具，结果玻璃破裂嵌入阴道，引起阴道外伤乃至大出血。更多的女子用手指进行手淫，手指因接触多种物品难免带有许多病菌，尤其是指甲缝中藏垢带菌，后患无穷。上述的种种不洁手淫，往往容易导致发生阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎以及输卵管炎。严重者还可以导致腹膜炎、败血症等反复的炎性破坏，输卵管内膜及肌层均可导致创伤如瘢痕形成、黏膜纤毛坏死最终会导致输卵管的梗阻及蠕动功能障碍，婚后可严重影响卵子、精子的运行及受精卵着床，导致不孕或宫外孕。经常手淫的未婚女子，盆腔淤血综合征、痛经等病症的发生率也相当高。手淫造成的心理障碍，也可造成不育；有些女子由于频繁手淫，身体罹患疾病，加上婚后性生活难以获得理想的效果，结果思想负担重，有的人还可发生性冷淡，给生育增添了许多困难。